디스크관리에 활성화 표시가 있던데요?

활성화로 된 파티션으로 부팅하는건데요. 예를 들어 c . d 하드가 나눠져 있는데  d를 활성화 하면. c에 운영체제가 깔렸다고 가정.

부팅이 안됩니다. d를 읽으려고 하기때문이죠. 항상 운영체제 깔린파티션을 활성화로..

백업하드로 쓰는곳은 상관없구요.

Koko님이 조금 잘못 알고 계신듯 하여.. 추가 설명 드리면...

C/D로 파티션이 나뉘어져 있고 D를 활성화하고 C에 O/S(윈도우로 가정합니다)를 깔면 윈도우는 C에 정상적으로 설치되고

윈도우의 부트 메니저는 활성화된 파티션(D)의 영역에 설치됩니다.

따라서 정상적으로 부팅이 됩니다. (활성화된 파티션에 꼭 윈도우를 설치할 필요가 없다는 뜻이죠)

떠오름님의 추가 질문은 각각의 O/S를 (XP와 7으로 가정합니다) 각각의 파티션에 설치하되 xp를 먼저 설치하신후 7을 설치하시면 됩니다.

물론 활성화 파티션은 어떤 파티션에 설정하셔도 관계없습니다. 또한 XP와 7이 설치될 파티션 또한 어디라도 상관없습니다.

주의하실점은 메인보드의 CMOS에서 부트디스크가 활성화된 파티션이 있는 디스크여야만 한다는 것이죠.

그래야 부트메니저를 찾을수 있을테니까요.

자세한 내용은 검색엔진에서 "하드디스크의 MBR" 관련으로 검색하시면 되리라 생각됩니다.